Después del funeral en la Plaza de San Pedro, el cuerpo del Benedicto XVI se desplazó hasta la Cripta de los Papas bajo la Basílica de San Pedro.

El cardenal italiano Giovanni Battista Re, decano del Colegio Cardenalicio, invitó a los presentes a rezar por el alma del Papa emérito.

Queridos hermanos y hermanas, pedimos humildemente a Dios, Padre misericordioso, por el Papa emérito Benedicto para que descanse en el Señor.

El arzobispo Georg Gänswein y las cuatro laicas que cuidaron del Papa emérito en sus últimos días estuvieron entre el grupo que cantó y rezó mientras los restos de Benedicto XVI fueron bendecidos.

Entre los presentes también hubo obispos y cardenales, como el Secretario de Estado vaticano, Pietro Parolin.

El ataúd de madera fue sellado, trasladado a otro metálico decorado con una cruz, el emblema del Papa y una inscripción en latín. Posteriormente, el féretro de metal se selló y metió en otro de madera con las mismas decoraciones.

Finalmente se introdujo el ataúd en su hueco y monseñor Gänswein pronunció una última bendición.